Reproducibilidad y datos abiertos en calidad de agua

Ignacio Alcántara

Ud. Bioestadística - Facultad de Veterinaria, UdelaR

2023-12-01

Floraciones algales

Consecuencias de las Floraciones algales

  • Pérdida de biodiversidad

  • Mal olor y sabor en el agua

  • Toxinas

  • Limitación de usos recreativos y potabilización

Causas de las floraciones

  • Nutrientes (N,P)

  • Temperatura del agua

  • Tiempo de residencia del agua

  • Luz solar

Imagen: Graham et al., 2016

Sustentado por evidencia nacional

Sustentado por evidencia nacional

Goyenola 2016; Kruk et al., 2023

Articulo BC20211

  • Eutrofización: enriquecimiento excesivo en nutrientes de un ecosistema acuático.

  • Autores del MGAP e INIA

  • Revista STOTEN:

    • Impact Factor 9.8
    • CiteScore 16.8

Principales conclusiones en BC2021

  • El pH, la conductividad eléctrica (\(EC_{w}\)) y la temperatura (T) modulan los niveles de microalgas (Chl-a).

  • La reducción de las emisiones de fósforo agrícola a los ríos no evitaría los altos niveles de Chl-a

  • La sustitución de la agricultura por pradera natural no evitaría las floraciones algales

  • La floraciones algales en Uruguay son impulsadas por el Cambio Climático

El peso de la evidencia para una afirmación extraordinaria debe ser proporcional a su rareza

Pierre-Simon Laplace

Reacción de la comunidad “Limnológica”

  1. ¿Quienes se benefician y quienes se perjudican con este “nuevo paradigma”?


  1. Cuestionar la metodología y veracidad de las afirmaciones planteadas en BC2021


  1. Escribir al editor de la revista resaltando algunos de los errores conceptuales
  • R: “Escriban un réplica al artículo original”

Del análisis propio a la respuesta

  • Datos: Observatorio Ambiental Nacional (2021)

  • Habilidades propias para revisión y manejo de bases de datos

  • Los datos de origen presentaban ciertas inconsistencias o artefactos que había que tomar decisiones claras.

  • Pero en BC2021 no se hacia mención alguna a estas particularidades

  • Nuestros gráficos no coincidian con los del trabajo

Construcción de una respuesta (reproducible)

  • Reproducibilidad: Trabajo que puede ser revisado y recreado de forma independiente utilizando los mismos datos y/o análisis publicados por los autores originales

White et al., 2013; Culina et al., 2020

Respondimos

  • Articulo de 11 páginas, aceptado con “revisiones menores”

  • 53 Autores nacionales de 18 afiliaciones diferentes!

Respondimos

¿Y después?

¿Y después? 😃

¿Y después? 😔

  • Respuesta de una página 👎

  • Aclararon procedimientos con los datos faltantes y erróneos 👍

  • Reconocen “errores de edición gráfica” en figuras 👍

  • No responden a los cuestionamientos sobre la interpretación de la información 👎

  • Sostienen su interpretación de que el pH potencia el aumento de la Chl-a desviando el foco de los nutrientes 👎

Lecciones aprendidas y reflexiones

Lecciones aprendidas

  • Cambio de cultura: es posible una comunidad colaborativa

  • Las editoriales siguen siendo un modelo de negocio

  • Datos abiertos: “Un gran poder conlleva una gran responsabilidad”

  • La revisión por pares se ha transformado en un medio para ayudar a los editores a decidir si un artículo es adecuado para su revista o no

  • Animarse a hacer y aportar por más chiquites que seamos

Reflexiones


  • ¿Cómo podemos hacer el sistema de revisión más transparente y eficiente para no perder la confianza en el mismo?


  • Reproducibilidad “material” vs “intelectual”


  • ¿Cuántos trabajos con sesgos no tan evidentes se nos escaparán?


  • Responsabilidad de los mensajes que se promueven desde el lugar que uno ocupa

Muchas Gracias

  • Co-autores:

    • Andrea Somma

    • Claudia Piccini

    • Felipe Garcia-Rodriguez

  • Al resto de los autores que participaron de la respuesta

  • Cátedra UNESCO de DDHH de Udelar y RETEMA

Referencias

  • Presentación realizada con Quarto

Información Complementaria

Articulo de BC2021

Metodología

  • Datos Públicos de calidad de agua (OAN - Min. Ambiente)

  • Dos ríos de Uy para entrenar una red neuronal (NNet)

  • Validaron NNet con un tercer río

  • Predicen concentración de algas (Chl-a) simulando distintos usos del suelo

  • “NNet herramienta libre de sesgo para determinar la influencia de variables sobre el fenómeno”

Observatorio Ambiental Nacional

  • Repositorio de datos públicos de calidad de Agua en Uruguay

  • Programas de monitoreo no estandarizados a nivel país

  • Fácil selección y descarga de archivos en formato .csv o .xls

  • Pobre documentación y metadata (hasta el 2021)

El ciclo cientifico

  • La ciencia no es una simple colección de “hechos y números”, es una herramienta cognitiva que funciona en base a consensos

  • “La ciencia es cómo, no un qué, y mucho menos un quién” [Nogués 2018]


  • Revisión por pares: estándar de oro en la ciencia porque garantiza el rigor, la novedad y la consistencia de los resultados académicos

Publicaciones científicas y revisión por pares

  • La revisión por pares ayuda a garantizar que el trabajo sea riguroso, coherente, utilice la investigación pasada y aumente lo que ya sabíamos

  • Dado que el conocimiento científico es acumulativo y se construye sobre sí mismo, la confianza en el sistema es particularmente importante

  • El objetivo principal de la revisión por pares debe ser proporcionar retroalimentación a los autores para mejorar un manuscrito antes de su publicación

https://github.com/NAlcan/Reply_BC2021